Σκοπός του προγράμματος είναι αφενός η ανάληψη κοινών πρωτοβουλιών για την προστασία και την προαγωγή της δημόσιας υγείας, αφετέρου η ενημέρωση και υποστήριξη του πληθυσμού απέναντι στους κινδύνους και στα έκτακτα συμβάντα από την ανάδυση νέων λοιμώξεων, σε επίπεδο Περιφερειών και Περιφερειακών Ενοτήτων. Το πρόγραμμα αναπτύσσεται σε τρεις άξονες:
